DNA 双螺旋结构的描述。它的四个编码单元(A、T、C、G)分别用粉色、橙色、紫色和黄色进行颜色编码。

　　DNA 可能会因毒素、辐射甚至正常细胞分裂而受损，但人类细胞必须不断修复 DNA 断裂才能生存。在无法有效修复 DNA 的细胞中，可能会发生导致癌症的变化(突变)。

　　大多数细胞依赖于同源重组或 HR 系统，该系统使用名为 BRCA1 和 BRCA2 的蛋白质来进行准确的 DNA 修复。然而，那些出生时 BRCA 基因出现故障的人通常会患上乳腺癌和卵巢癌，最近发现胰腺癌和前列腺癌中也存在 BRCA 突变和相关的 HR 问题。

　　因此，识别“HR 缺陷”癌症患者已成为该领域的首要任务，部分原因是此类癌细胞很容易受到破坏其 DNA 的靶向治疗的影响。为了找到 HR 缺陷的患者，标准实验室测试会寻找癌细胞 DNA 中的 “疤痕”，当使用草率的备用修复过程而不是 HR 来创建特定的突变模式时，就会发生这种情况。

　　虽然准确的疤痕诊断可以实现更有针对性的治疗，但研究人员对 HR 缺陷癌症中发现的微妙疤痕感到困惑。这些疤痕会在 DNA 代码(序列)中产生非常小的错别字，这些错别字在显微镜下是看不见的。然而，HR 缺陷细胞在称为染色体的更大 DNA 结构中显示出显着的结构重排，这些结构通过显微镜可见。

　　为了解决这一悖论，纽约大学朗格健康中心 Perlmutter 癌症中心的 Marcin Imieliński 博士和纪念斯隆凯特琳癌症中心 (MSKCC) 的 Simon Powell 博士应用了“基因组图”技术Imieliński 实验室开发的用于检测大规模 DNA 结构变化，这些变化会重新排列、复制和删除大量染色体。

　　他们的研究于8月16日在线发表在《自然》杂志上，分析的DNA分子比癌症分析中通常测量的DNA分子长一百倍。

　　应用这些方法，研究小组确定了“互惠对”，这是 HR 缺陷中出现的一种新疤痕类型。通过分析数千个癌症基因组，研究小组表明，当HR失败时，相互配对的疤痕会产生显微镜可见的特定染色体变化，从而更好地解释 HR 缺陷细胞的生物学特性。

　　Perlmutter 癌症中心癌症基因组学主任 Imieliński 说：“长分子告诉我们，这些疤痕来自两种备用修复机制——同源独立复制重启和单链退火——这可能使 HR 缺陷的癌细胞保持活力。”纽约大学朗格尼分校的主治病理学家。“阻断这些机制可能代表治疗这些癌症的新方法。”

　　研究作者指出，他们的新技术需要使用一种称为全基因组测序 (WGS) 的技术，但 WGS 成本正在下降。研究人员表示，使用他们的方法寻找更多 HR 缺陷患者并为他们匹配靶向治疗可能很快就会变得实用。